Padurile si rezervatiile naturale ale tarii sunt locuite de o varietate de animale salbatice. Mamiferele includ lupul iberic, vidra, pisica salbatica, mistretul si cerbul. Apele de coasta ale Portugaliei sunt populate de delfini, balene si foci, care atrag multi turisti iubitori de natura. Pentru iubitorii de pasari, Portugalia ofera o mare varietate de specii. Zonele umede si rezervatiile naturale de coasta sunt habitate ideale pentru multe specii de pasari migratoare, cum ar fi flamingo, starci, cormorani si rate. In plus, Portugalia gazduieste si mai multe specii de acvifere endemice. Pestele este abundent in apele atlantice ale Portugaliei continentale, in special sardinele europene. Crustaceele sunt comune pe coastele stancoase din nord, iar scoici si stridii sunt cultivate in
Algarve.