Vaquita, cel mai amenintat mamifer marin din lume, in Golful California. Iguana cu coada spinoasa din Baja California si diverse specii de chuckwallas sunt reptile notabile originare din regiune. Peninsula gazduieste, de asemenea, caprioare catar, oi bighorn si lince in zonele sale muntoase. Zonele de coasta sunt bogate in viata marina, inclusiv broaste testoase de mare verzi si numeroase specii de pasari, cum ar fi pelicanii bruni si pasarile fregate.